萨热克铜矿大地构造位置处于塔里木板块西北缘断坳带中的切列克苏—托云中新生代断陷带中,赋矿层位有两个,工业矿体赋存于上侏罗统库孜贡苏组上段(J₃k²)砾岩、砂砾岩中;地球化学背景显示萨热克盆地内Pb、Ba、Ag、Sb、As等在区域上具有相对富集的特征,而Cu、Ag的变异系数(Cv)相对较大,反映出其分散特征在盆地内是不均匀的,因此在局部地段形成富集从而有利成矿;矿源层的形成提供了萨热克铜矿成矿基础,构造活动是同层活化富集的动力,辉绿岩的侵入造成围岩褪色蚀变和含矿热卤水叠加富集成矿的基本条件,氧化淋滤是次生富集的根源。