库木塔什萨依萤石矿床位于阿尔金造山带,为近年所发现的具有大型找矿潜力的萤石矿床。区内萤石矿含矿建造为阿尔金岩群a岩组黑云斜长片麻岩建造、大理岩和碱长花岗岩建造,控矿、容矿构造为区域性北东向断裂及其次级断裂。萤石矿化主要赋存于萤石方解石脉中,次为构造角砾岩中。矿物成分简单,主要为萤石、方解石,次为石英和云母。萤石矿石和围岩(碱长花岗岩)的稀土地球化学特征显示区内萤石矿脉中主要含钙矿物(萤石、方解石)的成矿物质来源是相同的,且与围岩(碱长花岗岩)的物源具有相似性和继承性。综合研究表明,区内矿床类型为热液充填型萤石矿床,成矿时期较晚奥陶世碱长花岗岩成岩期晚,“阿尔金岩群a岩组黑云斜长片麻岩建造+晚奥陶世碱长花岗岩建造+区域性北东向断裂构造+F化探异常+碳酸岩化”是区内萤石矿的重要控矿因素。