恰罗石英岩矿大地构造单元为中祁连中间隆起带的东端,矿区出露地层主要为中元古界长城系磨石沟组第一岩性段(Chm1)、第二岩性段(Chm2),呈倾向南西的单斜层状,未见明显的褶皱、断裂构造。矿体赋存于长城系磨石沟组第二岩性段第二层(Chm2b)中,为一套浅海相沉积,经区域低级变质作用形成石英岩矿床。含矿层东西向延伸很大,该矿床资源远景很大。