黑龙江神树隐晶质石墨矿赋存于古生界二叠系下统土门岭组炭质板岩中,共划分为2个矿体,矿体呈透镜状、似层状产出,延长200m,延伸114~254m,厚度2.1~17m。矿石呈隐晶质结构,土状构造,主要矿物成分为石墨,平均含量75%以上。通过分析,矿床成因类型属接触热变质型石墨矿床。