磁黄铁矿多生于内生矿床中,在沉积岩中也可以见到。若生在接触变质矿床中,则多为矽卡岩晚阶段的产物,形成与标志性矽卡岩矿物如:透辉石、石榴子石、透闪石之后;并与黄铜矿、黄铁矿、磁铁矿、闪锌矿、毒砂等共生。一些热液矿床中也有磁黄铁矿产出,共生矿物有黑钨矿、辉秘矿、毒砂、方铅矿、闪锌矿、黄铜矿和石英等。本次研究所用祁漫塔格成矿带磁黄铁矿采自尕林格、虎头崖、景忍和肯德可克