凤凰山铜铁矿包含矽卡岩型和斑岩型两种矿化类型,前者受花岗闪长岩体与三叠系碳酸盐岩地层间的断裂-侵入接触带构造控制,后者受石英二长闪长斑岩体内部发育的断裂裂隙构造控制。矿床形成于燕山中期,成矿物质主要来自深源,部分为地层。