蓝细菌钙化作用是指某些蓝细菌属种可以利用水中的HCO₃^-进行光合作用而引起细胞外的胶鞘附近PH值上升,从而引起水体中的碳酸钙过饱和而在其胶鞘(EPS)内部或表面沉淀。发生钙化的蓝细菌胶鞘可以保存为化石,确切的钙化蓝细菌化石从新元古代开始大量出现,在古生代和中生代的某些时期的海相碳酸盐地层中广泛分布,是地质历史时期蓝细菌的重要记录。因蓝细菌胶鞘化石形态简单,生物真实面貌复原难度大,以及特征标准缺