东天山红岭钼矿大地构造位置处于觉罗塔格晚古生代沟弧带,成矿带位于康古尔-土屋-黄山Cu-Ni-Ti-Au-Ag-Mo-Pb-Zn-RM-硫铁矿-硅灰石-玉石矿带中,矿区出露地层主要为古元古界长城系星星峡岩群的一套区域变质岩及少量接触变质岩;矿区构造以NE向断裂为主,是矿区的主要控矿容矿构造;矿区岩浆岩主要为二长花岗岩,多呈岩基、岩株状产出。赋矿地层为古元古界长城系星星峡群第一岩性段,含矿岩体为晚三叠世二长花岗斑岩,矿石与石英细、网脉关系密切,呈它形细粒状、片状结构,星点状、细脉状构造;金属矿物主要有黄铁矿、黄铜矿、辉钼矿、闪锌矿、钛铁矿、磁铁矿等,次生金属矿物见有孔雀石、褐铁矿等。围岩蚀变以钾化、绿泥石化、绢云母化、绿帘石化等低温蚀变为主。含矿岩体SiO₂含量70.95⁶9.4%,Al₂O₃含量12.73¹3.84%,Fe₂O₃+FeO含量2.84⁴.12%,MgO含量0.49⁰.92%,P₂O₅含量0.048⁰.1%,CaO含量0.91⁰.2.55%,Na₂O+K₂O含量7.2⁸.28%,碱度较高,K₂O>Na₂O,岩石富钾,里特曼指数1.91².46,DI分异指数81.94⁸7.51,成岩岩浆具有良好的分异特性,岩浆为S型钙碱性花岗岩;岩石物源来自地壳,产于碰撞造山期。含矿岩体是在碰撞造山环境中,壳源物质经重熔而成。红岭钼矿在地层、构造、岩浆岩、地球物理及地球化学特征方面与白山钼矿、东戈壁钼矿类似,总体特征表明该矿床为斑岩型钼矿床。