万山—松桃铅锌矿地处鄂湘黔铅锌成矿带南段,所属大地构造单元为上扬子地台东南部被动边缘与雪峰基底逆冲过渡带,是贵州重要铅锌矿成矿区之一。区内铅锌矿床的赋矿层位清虚洞组为汇聚背景下被动大陆边缘盆地沉积的产物,主要形成于碳酸盐台地边缘滩(礁)相环境,且Pb、Zn地球化学背景值高,为成矿物质初始富集及后期成矿提供矿源;区域性铜仁—花垣深大断裂与江口—保靖断裂控制矿床(点)分布,其旁侧的次级构造控制矿体产出形态及规模。同位素研究表明,形成铅锌矿床的矿化剂硫主要来源于下伏地层中的蒸发岩和同期沉积海水;形成脉石矿物的碳来源于海相碳酸盐岩和原生碳酸岩的去气作用;而成矿金属元素主要来源于壳源;成矿流体具后生、低温、中高盐度热液特征,与同沉积建造水和大气降水活动有关,可能有部分变质水混入。铅锌矿床在成因类型上可归属于MVT型,主成矿期为加里东期,存在华力西期叠加特点。