庙沟铅锌矿产出于中元古宽坪群二云母石英片岩、中厚层大理岩、绿帘钠长片岩交替夹互的频变部位,矿体与围岩整合产出,矿层的顶底板均为特征相同的稳定浅海相碳酸盐岩和碎屑石英的中厚层大理岩。矿层与围岩多为突变整合接触,矿石以块状硫化物为主,矿石和围岩中均残留有沉积—成岩—后生期的组构。属热液沉积弱改造型矿床。