早三叠世在盆地南缘继承了二叠纪碳酸盐台地的沉积环境,早三叠世晚期为隆务河组深海~半深海相复理石碎屑岩沉积和扎里山组碳酸盐岩、马热松多组白云质碳酸盐岩沉积,中三叠世早期为郭家山组碳酸盐台地、光盖山组陆棚斜坡相重力流沉积,中三叠世晚期为大河坝组滨浅海相碳酸盐岩沉积。中三叠世末,受印支前幕的影响,大陆动力学体制由伸展向挤压转换,随着可可西里微陆块和羌塘微陆块的迅速北移,浩瀚的古特提斯洋逐渐关闭,褶皱回返。受其影响,作为古特提斯东端海域的南秦岭海域也在强大的北北东向压力(即区域主压应力方向)之下缩小,闭合、褶皱回返,从而结束了西秦岭三叠纪盆地的沉积历史。