苦尔萨依铜矿大地构造位置处于伊犁亚板块的伊什基里克山晚古生代裂谷带的南部。伊什基里克晚古生代裂谷带是在早古生代褶皱基底上发展起来的火山—沉积盆地,铜矿体产于下石炭统大哈拉军山组一套中性—酸性熔岩和火山碎屑岩中;夹碎屑岩和灰岩透镜体,矿床成因为属岩浆期后热液型铜矿床。