九仗沟金矿位于外方山银金多金属成矿带,矿体呈脉状赋存于M1构造蚀变带角砾岩、碎裂岩和蚀变岩中,并严格受构造破碎带控制,共圈出3个矿体,主要发育有钾化、硅化、黄铁矿化、绢云母化和碳酸盐化等围岩蚀变;金以包裹金和单体金赋存于黄铁矿、方铅矿和褐铁矿等矿物中,为典型的构造蚀变岩型中低温热液金矿床。