矿区处于三江褶皱系与扬子准地台的结合部位,兰坪-思茅凹陷盆地西缘。区内出露三叠系、侏罗系、第四系地层,矿区位于尚山山脉的南端-水思背斜和仙石山脉-上别列向斜,F111与F1两断裂的聚汇部位,铜矿体赋存在阿林向斜两翼中。阿林铜矿③-2号主矿体赋存于阿林向斜西翼与地层接触界面发育的F4层间断裂破碎带中,结合西侧相邻的纸房河铜矿最新勘查成果,认为矿区东部深部有一定找矿前景。