黑山头铜矿点位于准噶尔板块南缘增生带,大南湖古生代岛弧带,康古尔断裂北,至吐哈盆地南缘,地表出露为中奥陶系荒草坡群大柳沟组,围岩岩性为岩屑晶屑凝灰岩,岩石普遍发育绿泥石化、碎裂岩化、褐铁矿化,黄铁钾钒,矿点成因类型为中低温热液交代变质-中酸性火山岩型。