新疆土根曼苏铜矿床赋存于早石炭世库山河群上组岩层中,矿体呈层状、似层状产出,受地层、构造的控制。笔者主要利用岩矿鉴定、电子探针、扫描电镜等分析方法查明了本区金属矿物从早到晚主要为黄铁矿、黄铜矿、斑铜矿、辉铜矿、铜蓝、自然铜、黑铜矿、孔雀石等,且相互交代关系明显。同时,根据该区矿物共生组合及其在垂向上空间分布的差异,大致可将矿床分为氧化带、次生硫化物带和原生硫化物带,其中氧化带以孔雀石为标志性矿物,次生硫化物带以辉铜矿、斑铜矿、铜蓝、蓝铜矿为主,原生硫化物带则主要以黄铁矿、黄铜矿为主。研究发现,矿体主要赋存在次生硫化物带中,古陆的风化剥蚀为矿床提供了基本的成矿物质,库山河群上组的巨厚石膏层被认为是S^2-的主要来源,盆地为矿体形成提供了良好的赋存条件。在后期构造应力作用下,含矿地层不断地被挤压抬升至潜水面以上,在表生氧化、淋滤等作用下使铜硫化物不断发生叠加交代,从而使铜元素不断富集,形成了铜矿体。