西科1井白云岩主要分布于上新统莺歌组二段、上中新统黄流组、中中新统梅山组二段和下中新统三亚组二段中,其它组段均有零星分布。含锰质矿物的白云岩主要分布于黄流组一段及三亚组一段。在西科1井岩心中,锰质矿物的类型可分为3种:(1)白云岩表面的黑色斑点,(2)沿褐色条带分布的斑点及(3)沿断层涂抹分布。经显微薄片、扫描电镜和电子探针分析,其含有锰、铁、镍等金属元素,推断为软锰矿和黑锰矿,显示锰质矿物多来源于热液流体,在地质历史时期构造运动强烈时海底海盆扩张,在孤立台地边缘则发育正断层,岩浆成因的热液沿断层上涌,造成已形成的白云岩在成岩演化过程中受热液流体的改造,由此提出热液携带含锰物质上涌模式,其对白云岩有强烈的改造作用。