云南大姚铜矿六苴矿体呈层状、似层状、透镜状分别赋存于上白垩统马头山组(K₂m)和下白垩统高峰寺组(K₁g)紫红色碎屑岩系中,矿体产状与岩层产状一致,地层控矿明显。后期的地质构造活动对成矿有一定的叠加改造作用,为典型的沉积-改造型矿床。