托库特拜铁矿位于玛因鄂博断裂以南,喀拉通克晚古生代岛弧带内。构造单元内地层主要受区域变质作用的影响,变质程度最高可达低绿片岩相。区内侵入岩较为发育,岩石类型从基性至酸性均有出露,但以酸性岩为主。区内为晚石炭世壳源、混源花岗岩类和早二叠世混源花岗岩类。区内变质程度较低,变质作用大致可划分为区域动热变质作用、区域动力变质作用、动力变质作用、接触变质作用及气成水热交代变质作用5种类型。