克其克铜矿位于奥依塔格-库尔良晚古生代裂谷中,北东临铁克里克断隆,区域上均属克孜勒陶-考库亚陆缘盆地,具有较好的成矿环境及成矿条件。矿体赋存于中泥盆统克孜勒陶组中,为一套石英砂岩-粉砂岩建造;矿体围岩主要为细粒石英砂岩,近矿围岩可见明显的褪色蚀变带,矿体表现出一定的层位控矿特征,且均位于褪色蚀变带内。