以某铀矿酸法生产堆和生物法试验堆为研究对象,采用16SrRNA基因克隆文库和微生物多样性分析法比较不同浸出时期样本中的微生物群落组成差异,探讨影响微生物群落组成的主要因素。结果显示,酸法堆浸体系中微生物多样性和丰富度均高于生物堆浸体系;酸法和生物法堆浸体系中,共同的优势菌为At.ferrooxidans、L.ferriphilum和At.thiooxidans,是酸性硫化矿物环境中的主要类群;影响含氟铀矿石堆浸体系细菌类群的主要因素是体系的总氟离子浓度和pH。酸法堆浸的中后期属有铁/硫氧化等嗜酸菌存在的弱生物堆浸体系;生物堆浸体系中微生物多样性主要受到人工强化菌群控制;极低pH、高氟浓度降低微生物群落中细菌的相对丰度和多样性。