生物冶金技术是新世纪迅速发展起来的低品位矿产资源开发利用的高效、低耗的新型工业化技术,但在大规模产业化应用方面存在以下瓶颈难题,制约生物冶金技术的发展:①高效菌种选育难:常规选育方法速度慢、细菌活性低,且极端环境条件下菌种选育难;②工业应用规模小:我国大多数低品位铜、镍、钴、铀等有色金属矿石中,有价金属及硫品位低,杂质及毒性元素含量高,浸出率低,规模小,需开发适合不同浸矿体系的工业调控及大型工程化技术;③设备核心技术国外垄断:我国是采用生物预氧化技术建厂最多的国家,反应器的关键部件大都从国外引进或采用常规湿法冶金搅拌器,高效设备研发技术严重落后。