蒙古国巴彦查干铜矿位于南蒙古构造单元,戈壁阿尔泰构造岩浆带之东段,亦是蒙古巨型断裂带西段南侧。该构造带代表了海西期地壳消减带,具有良好的成矿环境及成矿条件。矿体赋存于泥盆系格其格尼组中,为一套浅变质的基性-中-酸性火山-沉积建造;矿体围岩主要由石英绿泥石片岩、绿泥石片岩组成,表现出一定的岩性控矿特征和层位控矿特征;区内发育有近东西向、近南北向和北东向三组断裂,断裂既控制了蚀变带又控制矿体,铜矿体赋存于构造蚀变带中;酸性岩体为铜矿提供了成矿物质和热液来源。