金山矿区位于科古尔琴山南麓,处于克孜勒库拉河-恰特尔塔尔河-琼阿希河之间的一个近南北向延伸展布的河间地块式山岭地带,为剥蚀中低山地形。地处博罗努早古生代岛弧的西段,受控于叶拉苏石炭纪上叠火山盆地的西北边缘,地质构造比较复杂。